Desde 1990 el INICNE es una institución de referencia en el estudio, la evaluación y el manejo de la diversidad de la fauna íctica de agua dulce, con un estrecho vínculo con los emprendimientos piscícolas del NEA. Su premisa es ahondar en el conocimiento de la fauna ictícola de la región y brindar asistencia técnica y extensión en las áreas de Biodiversidad, Pesquerías y Piscicultura. Con tareas de investigación, docencia, extensión y transferencia tecnológica, es una institución de trayectoria en la formación de recursos humanos. La realización de proyectos de investigación permitió transferir conocimientos a diferentes actores de la sociedad, contribuyendo a la conservación de la biodiversidad y explotación pesquera sustentable, y en el estudio de los ensambles naturales de peces tanto en el río como del macrosistema Iberá. Los monitoreos sistemáticos permitieron registrar más de 220 especies de peces, algunas nuevas para la ciencia y otras para las que se amplió su distribución. El conocimiento adquirido fue plasmado en publicaciones, libros o capítulos de libro. Mediante convenios con diferentes estamentos, se desarrollaron censos de pescadores, talleres de divulgación orientados a la conservación y uso sustentable de los recursos ícticos. Estos trabajos permitieron recomendar acciones para un mejor aprovechamiento del pescado de captura, al tiempo que se diseñó en conjunto con las autoridades de Chaco y Corrientes un novedoso sistema de veda pesquera, el que se viene aplicando con éxito desde 2010. Los informes técnicos permitieron recomendar acciones a organismos nacionales y provinciales. Estas y otras acciones determinaron que algunos integrantes del INICNE fueran seleccionados como consultores en proyectos de ordenamiento pesquero de la FAO o PNUD, al tiempo que en la actualidad participamos como institución de referencia en el estudio de prefactibilidad de la represa Itatí-Itá Corá. Recientemente se inició un estudio de pesca deportiva en el río Paraná.